Para parar/iniciar o MySQL usando o MySQL Workbench:
- Selecione Servidor> Inicialização/Desligamento no menu superior
- Uma guia será aberta mostrando se o servidor foi interrompido ou iniciado. Clique em Parar servidor ou Iniciar servidor conforme necessário.
Aqui estão as capturas de tela para as etapas acima.
Menu principal
Selecione Servidor> Inicialização/Desligamento no menu superior do MySQL Workbench:

A tela de inicialização/desligamento
Uma guia será aberta mostrando se o servidor está parado ou iniciado. Clique em Parar servidor ou Iniciar servidor como requerido:

Observe que parar o servidor MySQL fechará todas as conexões atuais e nenhum aplicativo poderá usar o servidor até que ele seja iniciado novamente.