Mysql
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Terminando conexões mysql ociosas

Limpeza manual:


Você pode MATAR o processid.
mysql> show full processlist;
+---------+------------+-------------------+------+---------+-------+-------+-----------------------+
| Id      | User       | Host              | db   | Command | Time  | State | Info                  |
+---------+------------+-------------------+------+---------+-------+-------+-----------------------+
| 1193777 | TestUser12 | 192.168.1.11:3775 | www  | Sleep   | 25946 |       | NULL                  |
+---------+------------+-------------------+------+---------+-------+-------+-----------------------+

mysql> kill 1193777;

Mas:
  • o aplicativo php pode relatar erros (ou o servidor web, verifique os logs de erros)
  • não conserte o que não está quebrado - se você não tiver poucas conexões, deixe-as em paz.

Serviço de limpeza automática;)


Ou você configura seu servidor mysql configurando um tempo limite menor em wait_timeout e interactive_timeout
mysql> show variables like "%timeout%";
+--------------------------+-------+
| Variable_name            | Value |
+--------------------------+-------+
| connect_timeout          | 5     |
| delayed_insert_timeout   | 300   |
| innodb_lock_wait_timeout | 50    |
| interactive_timeout      | 28800 |
| net_read_timeout         | 30    |
| net_write_timeout        | 60    |
| slave_net_timeout        | 3600  |
| table_lock_wait_timeout  | 50    |
| wait_timeout             | 28800 |
+--------------------------+-------+
9 rows in set (0.00 sec)

Definido com:
set global wait_timeout=3;
set global interactive_timeout=3;

(e também definido em seu arquivo de configuração, para quando seu servidor reiniciar)

Mas você está tratando os sintomas em vez da causa subjacente - por que as conexões estão abertas? Se o script PHP terminou, eles não deveriam fechar? Certifique-se de que seu servidor web não esteja usando o pool de conexões...