Mysql
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Selecionando linhas aleatórias com MySQL


O ORDER BY RAND() A solução que a maioria das pessoas recomenda não é dimensionada para tabelas grandes, como você já sabe.
SET @r := (SELECT FLOOR(RAND() * (SELECT COUNT(*) FROM mytable)));
SET @sql := CONCAT('SELECT * FROM mytable LIMIT 1 OFFSET ', @r);
PREPARE stmt1 FROM @sql;
EXECUTE stmt1;

Eu abordo esta e outras soluções em meu livro, SQL Antipatterns:Avoiding the Pitfalls of Database Programming .

Se você quiser fazer isso com PHP, você pode fazer algo assim (não testado):
<?php
$mysqli->begin_transaction();
$result = $mysqli->query("SELECT COUNT(*) FROM mytable")
$row = $result->fetch_row(); 
$count = $row[0]; 
$offset = mt_rand(0, $count);
$result = $mysqli->query("SELECT * FROM mytable LIMIT 1 OFFSET $offset");
...
$mysqli->commit();