Você deve colocar todas as alterações no seu método onUpgrade você pode usar este código:
@Override
public void onUpgrade(SQLiteDatabase db, int oldVersion, int newVersion) {
String sql = "ALTER TABLE " + TABLE_SECRET + " ADD COLUMN " +
"name_of_column_to_be_added" + " INTEGER";
db.execSQL(sql);
}
isso adiciona uma coluna em seu banco de dados atual. Seu banco de dados não perderá dados. Lembrete:onUpgrade será chamado quando getWriteableDatabase ou getReadableDatabase for executado E a versão do seu banco de dados for diferente da sua versão mais antiga.