você pode usar Explicar para mostrar como o otimizador de consulta tratará sua consulta.
http://www.postgresql.org/docs/9.2/static /sql-explain.html
No caso acima o PSQL deve ver que o temp3 não é usado e não o inclui.
usando seu exemplo acima em um dos meus dbs.
explain with temp1 as (select * from cidrs), temp2 as (select * from contacts), temp3 as ( select * from accounts ) select * from temp1 join temp2 on temp1.id = temp2.id;
QUERY PLAN
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Hash Join (cost=22.15..25.44 rows=20 width=4174)
Hash Cond: (temp1.id = temp2.id)
CTE temp1
-> Seq Scan on cidrs (cost=0.00..11.30 rows=130 width=588)
CTE temp2
-> Seq Scan on contacts (cost=0.00..10.20 rows=20 width=3586)
-> CTE Scan on temp1 (cost=0.00..2.60 rows=130 width=588)
-> Hash (cost=0.40..0.40 rows=20 width=3586)
-> CTE Scan on temp2 (cost=0.00..0.40 rows=20 width=3586)
(9 rows)
você não notará nenhuma menção a temp3. Ao responder à sua edição, sobre por que ela não afeta o tempo de consulta, o otimizador é inteligente o suficiente para ver que não é usado e não se incomoda em computar. Daí a razão de ser um otimizador.