Seu ponto de partida deve ser Como escolher um ambiente do App Engine guia, levando em consideração todas as suas necessidades.

Esse requisito facilita bastante a escolha. De Conexão do App Engine :

Ambiente tão flexível que é.

Isso depende do ambiente que você usa. O que você tentou foi o modo env padrão.

No ambiente flexível, as dependências são tratadas de forma diferente. De Dependências :