Deve funcionar fora da caixa com PostgreSQL, verificado com pg gem e rails 3.2:
class Multitest < ActiveRecord::Migration
def up
execute <<-SQL
create table x(id serial primary key);
create table y(id serial primary key, i integer);
SQL
end
def down
end
end
Em uma nota lateral, manipular
schema_migrations
diretamente parece estranho.