Como você mencionou em sua pergunta, mas vou reiterar aqui para futuros leitores:também é possível usar cursores explicitamente nomeados sem ignorar a API pública do Django:
from django.db import connection, transaction
with transaction.atomic(), connection.cursor() as cur:
cur.execute("""
DECLARE mycursor CURSOR FOR
SELECT *
FROM giant_table
""")
while True:
cur.execute("FETCH 1000 FROM mycursor")
chunk = cur.fetchall()
if not chunk:
break
for row in chunk:
process_row(row)