SQLAlchemy várias chaves estrangeiras em uma classe mapeada para a mesma chave primária

Tentei remover aspas das chaves estrangeiras e torná-las uma lista. Da documentação oficial em Relationship Configuration: Handling Multiple Join Paths

Alterado na versão 0.8:relationship() pode resolver a ambiguidade entre destinos de chave estrangeira com base nas foreign_keys argumento sozinho;o primaryjoin argumento não é mais necessário nesta situação.

O código independente abaixo funciona com sqlalchemy>=0.9 :

from sqlalchemy import create_engine, Column, Integer, String, ForeignKey
from sqlalchemy.orm import relationship, scoped_session, sessionmaker
from sqlalchemy.ext.declarative import declarative_base

engine = create_engine(u'sqlite:///:memory:', echo=True)
session = scoped_session(sessionmaker(bind=engine))
Base = declarative_base()

#The business case here is that a company can be a stakeholder in another company.
class Company(Base):
    __tablename__ = 'company'
    id = Column(Integer, primary_key=True)
    name = Column(String(50), nullable=False)

class Stakeholder(Base):
    __tablename__ = 'stakeholder'
    id = Column(Integer, primary_key=True)
    company_id = Column(Integer, ForeignKey('company.id'), nullable=False)
    stakeholder_id = Column(Integer, ForeignKey('company.id'), nullable=False)
    company = relationship("Company", foreign_keys=[company_id])
    stakeholder = relationship("Company", foreign_keys=[stakeholder_id])

Base.metadata.create_all(engine)

# simple query test
q1 = session.query(Company).all()
q2 = session.query(Stakeholder).all()