Este não é realmente o trabalho do phpMyAdmin, uma GUI para iniciantes em MySQL.

Coloque a consulta em um script, em um loop que é executado 1.000.000 vezes.

Embora isso não seja uma referência muito boa de nada. Se você está tentando simular a demanda real, precisa ter alguns concorrentes atividade, não apenas 1.000.000 de consultas emitidas e retornadas uma de cada vez.