O modelo de renderização não está passando a variável agregada do pymongo para o modelo

Reduzindo isso para exatamente o que você está procurando neste momento (e corrigindo alguma sintaxe em seu modelo), tente uma compreensão de lista:

from django.shortcuts import render

def gettheAudit(request):
    theURLs = [x for x in mycol.aggregate([{"$unwind":"$tags"},{'$match': {'tags.tag.name':'A A',}},{'$project': {'url': 1, 'AR': 1, 'tags.tag.name': 1, 'tags.variables': 1, '_id': 0}},])]
    return render(request, 'templates/a.html', {'theURLs': theURLs})

templates/a.html:

   <ul>
      <li><h1>URLSSSS</h1></li>
      {% for theURL in theURLs %}
         <li>{{ theURL }}</li>
      {% endfor %}
   </ul>