"Usar" tanta memória não é tão ruim quanto parece ... O MongoDB (pelo menos parece) usar muita memória disponível, mas deixa para o VMM do sistema operacional dizer a ele para liberar a memória quando precisar. (consulte Cache nos documentos do MongoDB.)

Na maioria das vezes, está "usando" essa memória para cache, o que acelera drasticamente as coisas.

Você deve ser capaz de liberar toda e qualquer memória reiniciando o MongoDB.

No entanto, até certo ponto, o MongoDB não está realmente "usando" a memória ativamente ... continue lendo para obter muito mais detalhes nesta resposta ..

Como liberar o cache que é usado pelo Mongodb?