Isso ocorre porque no PyMongo v3.6 a assinatura do método para collection.aggregate() foi mudado. Um parâmetro opcional para
session foi adicionado. A assinatura do método agora é:aggregate(pipeline, session=None, **kwargs)
Aplicando isso ao seu exemplo de código, você pode especificar
allowDiskUse como abaixo:node = db.way.aggregate(pipeline=[
{'$unwind': '$node'},
{'$group': {
'_id': '$node',
'appear_count': {'$sum': 1}
}
},
{'$sort': {'appear_count': -1}},
{'$limit': 10}
],
allowDiskUse=True
)
Consulte também pymongo.client_session se você quiser saber mais sobre
session . 
