Também não consigo ver outra maneira, implementei isso antes e não tive problemas.
No seu caso, deve ser assim, você passa o
$follower_ids
de determinado usuário array como um argumento para sua função:$query = array("status_owner_id" => array('$in' => $follower_ids));
$cursor = $mongo->yourdb->statuses->find($query);
E se você indexar status (se você tiver ram suficiente para fazer isso) em owner_id você obterá os resultados muito rápido.
Espero ter ajudado, Sinan.