Em seu exemplo específico, você não precisa executar essas consultas separadamente. Você pode juntar os resultados assim:
coll.find(
{ $or : [
{ "coordinates.type" : "Point" },
{ "place.bounding_box.type" : "Polygon" }
]
},
{"coordinates" :1, "place.bounding_box.coordinates" : 1}
)
Você também pode usar $ e / $elementMatch em vez de $ ou