MongoDB
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mongodb obtém documento inteiro de um valor


Quando você chama bots.findOne({data}) ele retorna uma "Promessa", não os dados. Você precisa aguardar a resolução da Promise para obter os dados. Você pode tentar este código. 
   socket.on("bot_req_id", async function(data) {
       let db = mongoose.db("wumpusCave")
       let bots = db.collection("bots")
           console.log(data)
           let bot = await bots.findOne({data})
           console.log(bot);
           socket.emit("bot_res_id", bot)
   })

Este artigo pode ajudá-lo a entender o conceito:https://scotch.io/courses/10-need-to-know-javascript-concepts/callbacks-promises-and-async