O Mongodb usará automaticamente índices de modo que não é tratado por morphia. Você deve indexar campos que normalmente usaria para consultas, por exemplo:
Publicar:
{
title : "My title", // indexed
content : "My long long long long loooooong content" // Not indexed
}
No documento de postagem simples mostrado acima, você vê que o campo de título é indexado porque um mecanismo de blog geralmente pesquisa títulos em vez de conteúdo, mais o conteúdo usará muita memória RAM, portanto, pode não caber na memória. Esse pode não ser o melhor exemplo, mas mostra a ideia principal.
Sugiro que leia o link dos índices.
