Driver Mongo C# atualiza um elemento específico em uma matriz aninhada

Você precisa do $ operador posicional onde você pode especificar a condição no nível do documento e a condição no nível da matriz para localizar um único item aninhado em uma matriz de um documento específico. Em C# $ sinal é representado por -1 passado como um índice de sua matriz de modelo. Tentar:

var col = mydb.GetCollection<Document>("collectionName");
var id = new ObjectId("5babaaf5509f6d342da5abaa");
var elementName = "Car";
var newValue = 2;

var filterBuilder = Builders<Document>.Filter;
var filter = filterBuilder.Eq(x => x.Id, id) &
    filterBuilder.ElemMatch(doc => doc.Elements, el => el.Name == elementName);

var updateBuilder = Builders<Document>.Update;
var update = updateBuilder.Set(doc => doc.Elements[-1].Value, newValue);

Col.UpdateOne(filter, update);