MongoDB
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Conexão do MongoDB com o MongoLab no NodeJS no Heroku


Isso resolveu o problema para mim:
var options = { 
  server: { 
    socketOptions: { 
      keepAlive: 300000, connectTimeoutMS: 30000 
    } 
  }, 
  replset: { 
    socketOptions: { 
      keepAlive: 300000, 
      connectTimeoutMS : 30000 
    } 
  } 
};

Então coloque aqui:
if(process.env.MONGODB_URI) {
  mongoose.connect(process.env.MONGODB_URI, options);
} else {

  // Connect to local database

}