Uma abordagem de aumento de desempenho que você pode adotar é usar um disco RAM
por exemplo.:
mongod --smallfiles --noprealloc --nojournal --dbpath <ramdisk mounted localtion>
Veja também:
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http://edgystuff.tumblr.com/post/49304254688/how-to-use-mongodb-as-a-pure-in-memory-db-redis-style
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Criar disco RAM linux:https://unix.stackexchange.com/questions/66329/creating-a-ram-disk-on-linux/66331#66331
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http://www.phpmoadmin.com/mongodb-in-memory-database