O que você quer é:
mongo sm-repository2.db.qa.test.com:27017/testdb --eval "db.stats()"
Ou para scripts mais longos:
mongo sm-repository2.db.qa.test.com:27017/testdb script.js
Veja as opções completas na documentação .
mongo sm-repository2.db.qa.test.com:27017/testdb --eval "db.stats()"
mongo sm-repository2.db.qa.test.com:27017/testdb script.js