Encontrei duas maneiras de integrar o mongodb e o Neo4j. O primeiro foi sugerido por ryan1234 usando Gremlin junto com Gmongo. As etapas são as seguintes, de acordo com este excelente blog
1- Baixe o Gmongo e driver Java mongo
2- copie os dois arquivos jar no diretório neo4j/lib
3- Este é um exemplo. suponha que temos essa coleção (chamada segue) no mongodb
{ "_id" : ObjectId("4ff74c4ae4b01be7d54cb2d3"), "followed" : "1", "followedBy" : "3", "createdAt" : ISODate("2013-01-01T20:36:26.804Z") }
{ "_id" : ObjectId("4ff74c58e4b01be7d54cb2d4"), "followed" : "2", "followedBy" : "3", "createdAt" : ISODate("2013-01-15T20:36:40.211Z") }
{ "_id" : ObjectId("4ff74d13e4b01be7d54cb2dd"), "followed" : "1", "followedBy" : "2", "createdAt" : ISODate("2013-01-07T20:39:47.283Z") }
a partir do shell Gremlin no Neo4j execute os seguintes comandos.
import com.gmongo.GMongo
mongo = new GMongo()
db = mongo.getDB("local")
db.follows.findOne().followed
x=[] as Set; db.follows.find().each{x.add(it.followed); x.add(it.followedBy)}
x.each{g.addVertex(it)}
db.follows.find().each{g.addEdge(g.v(it.followedBy),g.v(it.followed),'follows',[followsTime:it.createdAt.getTime()])}
e é isso que criamos o gráfico equivalente em neo4j