você pode tentar o seguinte na linha de comando
mongo 127.0.0.1/db --eval "var c = db.collection.find(); while(c.hasNext()) {printjson(c.next())}" >> test.txt
supondo que você tenha um banco de dados chamado 'db' rodando em localhost e uma coleção chamada 'collection', isso exportará todos os registros para um arquivo chamado test.txt
Se você tiver um script mais longo que deseja executar, também poderá criar um arquivo script.js e apenas usar
mongo 127.0.0.1/db script.js >> test.txt
Eu espero que isso ajude
