Depois do
Mongo 2.6
você pode fazer atualizações/upserts em massa. O exemplo abaixo faz atualização em massa usando c#
motorista. MongoCollection<foo> collection = database.GetCollection<foo>(collectionName);
var bulk = collection.InitializeUnorderedBulkOperation();
foreach (FooDoc fooDoc in fooDocsList)
{
var update = new UpdateDocument { {fooDoc.ToBsonDocument() } };
bulk.Find(Query.EQ("_id", fooDoc.Id)).Upsert().UpdateOne(update);
}
BulkWriteResult bwr = bulk.Execute();