Este problema foi resolvido. Recurso de atualização de campos dentro de uma matriz aninhada de objetos, está disponível nas versões MongoDB 3.6+. Veja os operadores posicionais (todos e com identificador) aqui.
//Update all docs in collection matching photo name "play" to "play photo"
db.collectioname.update(
{},
{ $set: { "albums.$[].photos.$[photo_field].name": "play photo" } },
{ arrayFilters: [ {"photo_field.name": "play"} ], multi: true}
);
//Update this specific doc given in question matching photo name "play" to "play photo"
db.collectioname.update(
{"_id" : ObjectId("4f41a5c7c32810e404000000")},
{ $set: { "albums.$[].photos.$[photo_field].name": "play photo" } },
{ arrayFilters: [ {"photo_field.name": "play"} ]}
);
Isto é para ajudar as pessoas que vêm aqui depois do MongoDB 3.6