MongoDB incorporado ao executar testes de integração

Eu encontrei a biblioteca Embedded MongoDB que parece bastante promissora e faz o que você pediu.

Atualmente suporta versões do MongoDB:1.6.5 para 3.1.6 , desde que os binários ainda estejam disponíveis no espelho configurado.

Aqui está um pequeno exemplo de uso, que acabei de tentar e funciona perfeitamente:

public class EmbeddedMongoTest {
    private static final String DATABASE_NAME = "embedded";

    private MongodExecutable mongodExe;
    private MongodProcess mongod;
    private Mongo mongo;

    @Before
    public void beforeEach() throws Exception {
        MongoDBRuntime runtime = MongoDBRuntime.getDefaultInstance();
        mongodExe = runtime.prepare(new MongodConfig(Version.V2_3_0, 12345, Network.localhostIsIPv6()));
        mongod = mongodExe.start();
        mongo = new Mongo("localhost", 12345);
    }

    @After
    public void afterEach() throws Exception {
        if (this.mongod != null) {
            this.mongod.stop();
            this.mongodExe.stop();
        }
    }

    @Test
    public void shouldCreateNewObjectInEmbeddedMongoDb() {
        // given
        DB db = mongo.getDB(DATABASE_NAME);
        DBCollection col = db.createCollection("testCollection", new BasicDBObject());

        // when
        col.save(new BasicDBObject("testDoc", new Date()));

        // then
        assertThat(col.getCount(), Matchers.is(1L));
    }
}