Nome da coluna de alias na instrução de maiúsculas e minúsculas

Você não pode usar aliases de coluna no mesmo SELECT cláusula. Você tem duas opções:

Use uma subconsulta:

SELECT Alias1,
       CASE
            WHEN Alias1 = FieldA1 THEN FieldA0
            WHEN Alias1 = FieldB1 THEN FieldA1
            ELSE NULL
       END AS Alias2 
FROM (
    SELECT CASE 
                WHEN FieldA = 'TestA' THEN FieldA1
                WHEN FieldB = 'TestB' THEN FieldB1
                ELSE NULL
           END AS Alias1,
           FieldA1
           FieldB1
    ...)

ou você pode repetir a lógica que você usou no primeiro CASE :

SELECT CASE 
            WHEN FieldA = 'TestA' THEN FieldA1
            WHEN FieldB = 'TestB' THEN FieldB1
            ELSE NULL
       END AS Alias1,
       CASE 
            WHEN FieldA = 'TestA' THEN FieldA0
            WHEN FieldB = 'TestB' THEN FieldB0
            ELSE NULL
       END AS Alias2