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SQL - Remoção avançada de duplicatas usando ID NOT IN


Você pode usar ROW_NUMBER função analítica e correlacionar a exclusão usando o ROWID pseudo-coluna:
DELETE FROM my_table
WHERE ROWID IN (
  SELECT ROWID
  FROM   (
    SELECT ROW_NUMBER() OVER (
             PARTITION BY student_id, subject_id, class_id
             ORDER BY expertise_lvl DESC
           ) AS rn
    FROM   my_table
  )
  WHERE  rn > 1
)

db<>fiddle aqui