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Como remover linhas repetidas em uma consulta Oracle SQL


Você pode reescrever esta consulta com sintaxe de junção como:
SELECT DISTINCT t.table_id
FROM   TABLE_ONE t
       JOIN COMMON_TABLE cmn
         ON t.table_id = cmn.common_id
WHERE  t.table_name IN( 'TEST_ONE', 'TEST_TWO', 'TEST_THREE' )
       AND cmn.column_one > 20
       AND cmn.column_two <= 30 

DISTINCT irá remover registros duplicados.

EDITAR:

você pode incluir sua tabela filho como:
SELECT DISTINCT t.table_id
FROM   TABLE_ONE t
       JOIN COMMON_TABLE cmn
         ON t.table_id = cmn.common_id
       JOIN TABLE_CHILD_ONE tc
         ON t.table_id = tc.table_id
WHERE  ( tc.table_name IN( 'TEST_CHILD_ONE', 'TEST_CHILD_TWO', 'TEST_CHILD_THREE' )
          OR t.table_name IN( 'TEST_ONE', 'TEST_TWO', 'TEST_THREE' ) )
       AND cmn.column_one > 20
       AND cmn.column_two <= 30