Aparentemente, no VS2012 com o ODAC mais recente, quando você configura os critérios de filtro de conexão você sempre precisa incluir o esquema padrão junto com o esquema desejado .
ATUALIZAÇÃO: Abaixo está a guia Filtros no assistente para adicionar (ou modificar) uma Conexão de Dados do Visual Studio Server Explorer.
Observe com atenção e observe que no campo Valor do 'Selecione os critérios de filtro', tenho dois valores de esquema (os valores reais são apagados da captura de tela) separados por uma vírgula. Um é o valor do esquema padrão e o outro é o esquema que eu quero. Você pode definir esses valores de esquema clicando nas reticências que marquei em vermelho.
Por algum motivo, não precisei fazer tudo isso no VS2010 com a versão anterior do ODAC, removi o esquema padrão e apenas adicionei o esquema que queria.
