Você pode encontrar um pdf com alguma documentação aqui:SSL com Oracle JDBC , você tem algumas páginas de exemplo de código 11 e 12:
String url = "jdbc:oracle:thin:@(DESCRIPTION=(ADDRESS=(PROTOCOL=tcps)(HOST=servername)(PORT=2484))(CONNECT_DATA=(SERVICE_NAME=servicename)))");
Properties props = new Properties();
props.setProperty("user", "scott");
props.setProperty("password", "tiger");
props.setProperty("javax.net.ssl.trustStore",
"/truststore/ewallet.p12");
props.setProperty("javax.net.ssl.trustStoreType","PKCS12");
props.setProperty("javax.net.ssl.trustStorePassword","welcome123");
Connection conn = DriverManager.getConnection(url, props);