Eu diria que você provavelmente vai querer fazer isso usando o sp_addextendedproperty proc armazenado.
A Microsoft tem uma boa documentação sobre isso.
Tente isto:
EXEC sp_addextendedproperty
@name = N'MS_Description', @value = 'Hey, here is my description!',
@level0type = N'Schema', @level0name = 'yourschema',
@level1type = N'Table', @level1name = 'YourTable',
@level2type = N'Column', @level2name = 'yourColumn';
GO
