SPs são pré-compilados, pode ser que um plano de consulta "ruim" seja usado, o que não é bom para os argumentos passados ​​para o SP. Você pode adicionar uma OPTION (RECOMPILE) nas consultas dentro do SP para forçar o SQL Server a executar novamente a consulta por meio do otimizador de consulta e encontrar a melhor consulta para os parâmetros fornecidos.

Veja aqui ou aqui para alguns exemplos e informações básicas...