Não está exatamente claro o que você está tentando fazer aqui, mas você pode criar um identificador em cada linha semelhante a este:
SELECT Id, 'M' as tbl
FROM MD_Master
UNION ALL
SELECT Id, 'P' as tbl
FROM CD_Personal
Isso permitirá distinguir entre cada linha, vendo de qual tabela o registro veio. Então, se você tiver registros com o mesmo
ID você saberá de que mesa veio. 
