Sim, claro que você pode fazer isso. Além disso, não há nada de especial para "orientá-lo" para a instalação - basta instalá-los.

O único ponto que você precisa estar ciente:se você tiver várias versões do SQL Server instaladas, elas precisam ter um nome da instância separado (que você escolhe no momento da instalação).

Por padrão, um SQL Server "regular" é instalado como uma "instância padrão" sem nome de instância explícito. O SQL Server Express por padrão usa o SQLEXPRESS nome da instância.

Então, basicamente:sim, é totalmente possível, basta escolher nomes de instância separados para ambas as instalações!