Você pode declarar uma variável fictícia e definir seu valor na cláusula WHEN MATCHED.
DECLARE @dummy int;
...
MERGE
...
WHEN MATCHED THEN
UPDATE SET @dummy = 0
...
Eu acredito que deve ser menos caro do que a atualização da tabela real.
DECLARE @dummy int;
...
MERGE
...
WHEN MATCHED THEN
UPDATE SET @dummy = 0
...