Para alterar o valor do contador AUTO_INCREMENT a ser usado para novas linhas, faça o seguinte:
ALTER TABLE `table_name` AUTO_INCREMENT = 1;
Para atualizar todas as suas 31 tabelas, você pode usar este script php:
<?php
$tables = array('table1','table2','tableX'); //continue here
foreach($tables as $update)
{
mysql_query("ALTER TABLE `".$update."` AUTO_INCREMENT = 1;");
}
?>