Mysql
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MySQL - Selecione dados com um JOIN, mas com cláusulas WHERE aplicadas a perímetros complexos e distintos


Use recipient NOT IN (SELECT ...) e author NOT IN (SELECT ...) para excluir os participantes que correspondem às suas condições 1 e 2.
SELECT             
          hia.query_result_id,
          hia.url,
          hia.title,
          hia.article_publication_day,
          hia.media_name,
          hia.author_full_name,
          hia.author_first_name,
          hia.author_last_name,
          hia.author_email,
          ces.sent_at
FROM
          Hobby_ideas_articles hia
LEFT JOIN
          Past_Customer_sent_messages ces
ON
          hia.author = ces.recipient 
            AND ces.recipient NOT IN (
                SELECT recipient
                FROM Past_Customer_sent_messages
                WHERE sent_at > DATE_SUB(NOW(), INTERVAL 3 HOUR)
            )
WHERE
          hia.hobby_id = HOBBY_ID_INPUT_I_HAVE AND         
          hia.author IS NOT NULL
          AND hia.author NOT IN (
            SELECT recipient
            FROM Past_Customer_sent_messages
            WHERE customer_id = CUSTOMER_ID_INPUT_I_HAVE
            AND sent_at > DATE_SUB(NOW(), INTERVAL 30 DAY)
          )

A condição em ces tem que estar no ON cláusula para que você obtenha sent_at = NULL para artigos que não têm linhas correspondentes.