Aqui está uma maneira insanamente complicada de fazer isso no MySQL, usando
JSON_TABLE
para converter a atualização e os valores JSON originais em colunas, mesclando as colunas usando um (simulado) FULL JOIN e, em seguida, recriar o valor JSON de saída usando JSON_OBJECT
e JSON_ARRAYAGG
; finalmente usando isso para atualizar a tabela original:WITH upd AS (
SELECT *
FROM JSON_TABLE('[{"substanceId": 182, "text": "substance_name_182_new"}, {"substanceId": 184, "text": "substance_name_184"}]',
'$[*]' COLUMNS (
substanceId INT PATH '$.substanceId',
txt VARCHAR (100) PATH '$.text')
) jt
CROSS JOIN (SELECT DISTINCT id
FROM test) t
),
cur AS (
SELECT id, substanceId, txt
FROM test
JOIN JSON_TABLE(test.j,
'$[*]' COLUMNS (
substanceId INT PATH '$.substanceId',
txt VARCHAR (100) PATH '$.text')
) jt
),
allv AS (
SELECT COALESCE(upd.id, cur.id) AS id,
COALESCE(upd.substanceId, cur.substanceId) AS substanceId,
COALESCE(upd.txt, cur.txt) AS txt
FROM upd
LEFT JOIN cur ON cur.substanceId = upd.substanceId
UNION ALL
SELECT COALESCE(upd.id, cur.id) AS id,
COALESCE(upd.substanceId, cur.substanceId) AS substanceId,
COALESCE(upd.txt, cur.txt) AS txt
FROM upd
RIGHT JOIN cur ON cur.substanceId = upd.substanceId
),
obj AS (
SELECT DISTINCT id, JSON_OBJECT('substanceId', substanceId, 'text', txt) AS o
FROM allv
),
arr AS (
SELECT id, JSON_ARRAYAGG(o) AS a
FROM obj
GROUP BY id
)
UPDATE test
JOIN arr ON test.id = arr.id
SET test.j = arr.a
;
SELECT JSON_PRETTY(j)
FROM test
Resultado:
[
{
"text": "substance_name_183",
"substanceId": 183
},
{
"text": "substance_name_184",
"substanceId": 184
},
{
"text": "substance_name_182_new",
"substanceId": 182
}
]
Demonstração no dbfiddle
Observe que isso pressupõe que você use um
id exclusivo valor para distinguir as linhas em sua tabela. Se você usar outra coisa, precisará trocar isso em onde id é usado na consulta acima. 
