Eu não tenho o MySQL nesta máquina para testar, mas acho que
SELECT myCol
FROM myTable
WHERE myCol REGEXP '^[0-9][0-9][A-Z]$'
Deve fazê-lo.
^ é uma âncora para o início da string, $ para o final da string e o resto deve ser autoexplicativo. Parece que você também pode usar
REGEXP '^[[:digit:]][[:digit:]][[:alpha:]]$' mas completamente não testado e apenas saindo dos documentos. 
