Ao olhar para suas capturas de tela, parece que está duplicando com base no número de tags em cada local. Isso seria da junção nas tags para poder filtrar os locais. Ao adicionar um distinto à sua consulta, ele eliminará os valores duplicados do banco de dados. Depois de fazer isso, você provavelmente desejará voltar a exibir valores duplicados, pois não será exibido se você fizer a mesma quantidade e valor de compras para uma determinada peça.
SELECT DISTINCT costlayer.qty AS Qty, costlayer.orgqty, costlayer.orgtotalcost,
costlayer.totalcost AS TotalCost, costlayer.datecreated AS DateCreated,
part.num AS PartNumber, part.description as PartDescription, asaccount.name as "InventoryAccount",
company.name AS company, currency.symbol
FROM CostLayer
LEFT JOIN Part ON part.id = costlayer.partid
LEFT JOIN Tag ON part.id = tag.partId
LEFT JOIN Location ON tag.locationId = location.id
LEFT JOIN LocationGroup ON location.locationGroupId = locationGroup.id
LEFT JOIN asaccount ON part.inventoryaccountid = asaccount.id
JOIN company ON company.id = 1
LEFT JOIN currency ON currency.homeCurrency = 1
WHERE costlayer.datecreated BETWEEN $P{dateRange1} AND $P{dateRange2}
AND costlayer.statusid IN ($P!{ckShowActiveCostingLayers},$P!{ckShowFulfilledCostingLayers},$P!{ckShowVoidedCostingLayers})
AND UPPER(part.num) LIKE UPPER($P{partNum})
AND (UPPER(COALESCE(asaccount.name,'')) LIKE UPPER('%' || $P{AssetAccount} || '%'))
AND LocationGroup.id LIKE $P{locationGroupID}
ORDER BY (CASE WHEN $P{AssetAccount} NOT LIKE CAST('%' AS varchar(256)) THEN asaccount.name ELSE part.num END), part.num ASC, costlayer.id, costlayer.datecreated