Crie uma tabela temporária e preencha-a com:
CREATE TEMPORARY TABLE temptable (id INTEGER, VALUE VARCHAR(200))
INSERT
INTO temptable
VALUES
('1', 'val1'),
('2', 'val2'),
('3', 'val3'),
('4', 'val4')
Em seguida, emita:
UPDATE
mytable m, temptable t
SET m.value = t.value
WHERE m.id = t.id
