Em vez de selecionar todos os campos com "SELECT *", você deve nomear explicitamente cada campo necessário, aliando-os com AS conforme necessário. Por exemplo:
SELECT si.field1 as si_field1,
si.field2 as si_field2,
ind_data.field1 as ind_data_field1
FROM sites_indexed as si
LEFT JOIN individual_data as ind_data
ON si.id = ind_data.site_id
WHERE `url` LIKE :url
E então você pode fazer referência aos nomes de alias em seu conjunto de resultados.
