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MYSQL Datetime, remova segundos


Esta é apenas uma questão de atualizar a coluna correspondente.

Dependendo do... hum... do seu humor (?) você pode tentar:
update tbl set datetime_column = substr(datetime_column, 1, 16);

Ou 
update tbl set datetime_column = date_format(datetime_column, '%Y-%m-%d %H:%i:00');

Ou 
update tbl set datetime_column = datetime_column - second(datetime_column);