Mysql
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Duas coisas:

1.Alterar
echo "<select name='train_name' id='train_name' multiple='multiple'>";

para
echo "<select name='train_name[]' id='train_name' multiple='multiple'>";

2.Alterar
function getAllAssoc() {
        $sql = "SELECT * FROM train_information WHERE train_name = :train_name";
        $sth = $this->pdo->prepare($sql);
        $sth->bindParam(":train_name", $_POST["train_name"]);
        $sth->execute();
        return $sth->fetchAll();
    }

para
function getAllAssoc() {
        $sql = "SELECT * FROM train_information WHERE train_name IN(:train_name)";
        $sth = $this->pdo->prepare($sql);
        $sth->bindParam(":train_name", implode(",",$_POST["train_name"]));
        $sth->execute();
        return $sth->fetchAll();
    }

Basta ajustar as aspas na consulta, pois não testei esse código e sinto que haverá um problema com aspas simples.

O que é feito acima é que pegamos as entradas em uma matriz e, consequentemente, buscamos os resultados com base nessa entrada de matriz.

Espero que tenha entendido!!