você precisa alterar seu arquivo de composição do docker, você deve adicionar
privileged: true
o meu se parece com: mysql:
build: ./DockerFiles/Mysql
ports:
- ${LOCAL_PHP_IP}:${MYSQL_PORT}:3306
privileged: true
environment:
MYSQL_ROOT_PASSWORD: root
volumes:
- /opt/mysql_data:/var/lib/mysql