Três opções básicas:
- faça tudo em C++, tornando seu programa um servidor web autônomo (possivelmente proxy através do apache para fornecer coisas como ssl, mídia estática, autenticação etc.)
- execute C++ em um cgi-bin, através do apache
- faça um wrapper PHP que se desloque para a parte C++ (esta é uma boa opção se a parte crítica ao desempenho for pequena, pois você ainda pode usar o conforto que a coleta de lixo e a manipulação de strings do PHP oferecem a você)