Você pode simplesmente usar
NÃO REGEX
:SELECT * FROM table
WHERE column_name NOT REGEX '^your[[:space:]]pattern here'
Roubado de comentário de Erick Jimenez . Acho que é melhor do que resposta de dan1111 .
Você também pode fazer
NOT (qualquer expressão)
então NÃO (column_name REGEXP 'pattern')
também funcionaria.