Tente isto:
// None of this belongs in a main method.
public static void main(String[] args) throws Exception {
Class.forName("com.mysql.jdbc.Driver");
// where are url, user, pass set? I don't see them.
Connection conn = DriverManager.getConnection(url, user, pass);
Statement stmt = conn.createStatement();
// this is simply wrong.
String mysql1 = "UPDATE Policy SET " + readAndArray("filepath");
}
Você é novo em Java e JDBC. Esta não é uma boa maneira de fazê-lo. Eu recomendo que você pesquise na web e SO para alguns exemplos de como fazê-lo melhor.