O erro não é que a classe não pode ser encontrada. Não está sendo permitido carregar porque o aplicativo da web foi interrompido. Suspeito que isso possa estar acontecendo depois que o aplicativo da Web for reiniciado, onde fica inativo por um curto período de tempo. Então alguns finalize() O método no código provavelmente está tentando fazer alguma limpeza tarde demais. Se isso está ou não no seu código ou no driver MySQL, não posso dizer. Você definitivamente deve ter apenas uma versão de um jar em um diretório por vez. Você pode querer atualizá-lo para o mais recente (5.1.15 agora) caso algo tenha sido corrigido que possa estar afetando você.